A MANNA rendszer funkcionalitásának gerincét az előirányzatgazdálkodási analitikus nyilvántartási folyamat képezi. A rendszer igen robosztus analitikus nyilvántartással rendelkezik, melyhez szorosan kapcsolódik a főkönyvi nyilvántartás. Az előirányzatgazdálkodási analitika a költségvetés kialakításától, annak folyamatos nyomon követésén, az egyes kötelezettségek, alapbizonylatok, utalványok idősoros nyilvántartásba vételén keresztül a pénzforgalom regisztrálásáig tartalmaz minden gazdasági eseményt.
Ehhez a nyilvántartási folyamathoz számos egyéb szakmai nyilvántartás kapcsolódik. Az itt megjelenő gazdasági események más szakmai nyilvántartások bemeneteként is szolgálhatnak, illetve az egyes szakmai nyilvántartások is generálhatnak gazdasági eseményeket az előirányzatgazdálkodás felé.